Для того, чтобы снять флажок пропущенного звонка, нужно:
Нажать на виджет с телефонной трубкой
Выбрать проект на котором есть пропущенные звонки
Открыть лид с пропущенным звонком
4. В лиде нажать на кнопку "Действия" и выбрать "Удалить из пропущенных звонков"
Также, флажок пропущенного звонка звонка будет снят, если есть принятый входящий или исходящий звонок клиенту после пропущенного.